Sebagaimana Pondok Pesantren umumnya bahwa aliran/faham yang dianut biasanya ditekannkan pada suatu faham yang lain.
Di pesantren Zainul Hasan semua faham dipelajarinya hanya saja penagalamannya diutamakan pada faham tertentu yaitu faham “AHLUSSUNNAH WAL JAMA’AH” yang bebarti : Ahlussunnah ialah penganut sunnah Nabi, sedang wal jama’ah penganut I’tiqod jama’ah sahabat-sahabat nabi.